質問

ちょっと前に見て気になっていたので参考として回答させていただきます。
どのようなＩ／ＦでHDDを接続されたか分かりませんが、同じような条件で実際に使っているので参考になればと思います。
HDDはIDEだと思いますが、同じようにノートに以前使っていたデスクトップ内蔵HDDをUSB2に接続するのに、GREEN HOUSE社のGH-USHD-IDE変換アダプタを使って外付けHDDとして使っています。
参考ウェブ
http://polo-web.com/ide-usb.html
GREEN HOUSE社のサイトです。
http://www.green-house.co.jp/products/storage/adapter/ide/index.html

さて、お望みのソフトをそっくりフォルダごとコピーしても動かないことは多いと思います。ほとんどのソフトは何らかのdllソフトを必要としているのでそれらも一緒にコピーしたら動く可能性はあると思います。そこでどんな依存ファイル( .DLL, .INI ファイアルなど）が必要かを検出するソフトにちょっと古いのですがIZON2というフリーソフトがあります。検索すればVECTORなどで見つけることができます。
実際にこれを使って移動・コピーなどしたことはありませんので保証はできませんが何かの参考になれば幸いです。

===補足===
依存ファイル検索ソフトIZON2について。
http://www.vector.co.jp/soft/dl/win95/util/se054263.html
ちなみにこのソフトをインストールすると、指定したフォルダ内には「IZONH.EXE」と「REDOME.TXT」の二つだけですが、このソフトを起動してIZONH.EXEを指定して検索すると以下のように表示されます。

検索ファイル:D:\Download\izon2\IZONH.EXE・・・・・・・インストールフォルダ

1: IMM32.DLL
2: CTL3D32.DLL
3: XX.CPP
4: XXTYPE.CPP
5: XXTYPE.CPy
6: ADVAPI32.dll
7: KERNEL32.dll
8: COMCTL32.dll
9: COMDLG32.dll
10: GDI32.dll
11: USER32.dll
12: OLEAUT32.dll
13: izonh.exe

13 個見つかりました !

確認したら最後の自分自身以外はすべて\WINDOWS \SYSTEM32のフォルダにありました。これらははじめからWindowsに入っているものでした。作者が独自のDLLファイルを作ってSYSTEM32フォルダにインストールすることがありますから、DLLがそろっていないと動いてくれないでしょう。
今場合IZONフォルダ内のコピーで動くはずです。

• 回答者：あいあいさー (質問から3日後)
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ＨＤＤを読み込めない状態なのでしょうか？
プログラムの集合体である、*.dllファイル等をコピーして、実行ファイル、*.exeファイルをたたけば、動作する可能は大きいですが。。。

また、Windows95で動作してたプログラムが、WindowsXPで動作する保証はないです。コマンドも変わってきてると思いますので。

ちなみに、使いたいソフトを調べていたら、トライアル版があるようなので、これをためしてみるといいかもしれませんね。
http://www.iti.iwatsu.co.jp/ja/products/mathcad/

• 回答者：コゼニゲバ (質問から1日後)
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Windowsのソフトの場合、まずプログラム本体であるexeファイルの他に、他の方も書いているレジストリ情報をいじる可能性もありますが、何といってもdll（ダイナミックリンクライブラリ）ファイルをかなり必要とします。このdllファイルがWindowsのバージョンによって、サポートされていない場合もあるので、微妙といえば微妙ですね。
まず、そのHDDを例えばUSBなどで繋いでみる。それから対象アプリのexeファイルを叩いて（ダブルクリック）みる。その時に、「アレが無い」「これが無い」と大体不満を打ち上げるのでそのシステムを移動していけば良いのですが・・・。
ただし、これを行うことによって、システムを不安定にしかねませんから、システムがクラッシュしても責任は取りませんよ。

• 回答者：ごーすけ (質問から16時間後)
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95だとdos/vと9800と大きく2種類があり、dos/vなら、プログラム本体とｉｎｉファイルやレジストリ登録で動く可能性はありますが、これもレジストリ次第です。
レジストリ登録されないソフトならコピーだけで動きますが、そうでないとDLLファイルを探し出したり手間暇かかります。
9800シリーズ専用だと、、、
9800シリーズ以外ではどうやっても動きません。
9800シリーズは日本語フォントをハードで持っており、専用ソフトはこれに依存します。
具体的なソフト名を挙げないとわかんない。

===補足===
dosv96年でwin95ならfatなので、今のdos/vならそのまま読めるはずです。
（IDE、scsi、sasi？どれ？型番がなきゃな）
それが読めないという事はHDそのものがだめなのでしょう。
当時はアカウント制御なんてありませんし、HDにパスワードを掛けられるものがごく一部（ibmぐらい）にあっただけです。
（パスワードを掛けられるアプリはあるが、あまり使われてなかったよね）
ディスクの磁気が消失したか、モーターやヘッドが固着している、基板が壊れたなど、直せる可能性が無いとは言いませんが非常に厳しいかと、、

• 回答者：gato7 (質問から9時間後)
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問題のHDDが読めるならコピーを作る手もあるし直接問題のソフトを起動する手もあります。
著作権保護のコピーガードがついていないなら事は簡単ですがコピー制限がある場合難しいかもしれません

• 回答者：匿名 (質問から3時間後)
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HDDを接続。I/Fがなければ用意する。
explorerなどでソフトを起動。パスのエラーが出るのならノートのHDDにコピーして試すとか環境設定を行うなど。

駄目ならノートのHDDを無効にして、デスクトップPCのHDDから起動。
OSが起動するならソフトを起動。

OSが起動しないかソフトが動かない場合は Windows95を購入。
ノートにWindows95をインストール。
ソフトを起動。

駄目ならデスクトップPCのHDDにWindows95を上書きインストール。ファイルが消える危険もあるため、やる前にバックアップを薦める。
ソフトを起動。

駄目ならレジストリをチェックし、自分の環境に合うように書き換えてみるなど。
当然ですが、必要なファイルがないといった場合はインストールすること。

• 回答者：匿名希望 (質問から3時間後)
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まず、おっしゃるそのソフトがハードディスクのどのフォルダに入っていて、どういう情報を元に動いているかによりますね。
ハードディスクのルートにいきなりソフトのフォルダがある様でしたら、恐らくそのままフォルダごとコピーしても動くタイプでしょう。
ただし、Windows XPとの互換性があるかどうかはわかりません。
（これは以下も同じ）

次に、そのソフトがアプリケーションの追加と削除にあるとともにProgram Filesのフォルダに入っている様ですと、Windowsのiniファイルだけで無く、レジストリにも環境を保存して動作させている可能性がありますので、動く可能性が微妙になるかもしれませんが、このProgram Files以下のソフトのフォルダごとコピーして動くかどうかですね。

一番はインストールファイルがあれば、スッキリ動くかどうかわかりそうですが、いずれにしても自己責任で、対応OSで無い環境で動作させた場合に不安定になってフリーズし、最悪そのことが原因で全体が不安定になることもありますので、慎重に様子を見ながらにした方がいいと思います。

• 回答者：補足意見 (質問から2時間後)
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それがどんなソフトなのかよくわからないのですが、多分同じようにきちんとインストールすることは出来ないでしょう。
しかし、そのソフトのインストールされているフォルダーをまるごとコピーすれば案外動いたりします。特に古いソフトではそうですので、まずは試してみたらどうでしょうか。

• 回答者：匿名 (質問から14分後)
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